農家の確定申告のやり方｜初心者が最初に押さえる準備と注意点

「農業を始めたけれど、確定申告って何をすればいいんだろう…」

農作業には慣れてきたのに、確定申告になると急に手が止まる。そんな方はとても多いです。

丹羽いちご園でも、最初の頃は領収書や売上の記録をどう管理すればいいかわからず、申告前に慌てた経験があります。農業は現金売上・直売・資材購入・農薬・肥料・燃料代・設備投資が混ざりやすく、あとから「これは何の支払いだったか」を思い出すのが一番大変です。

この記事では、新規就農・副業農業・小規模農家の初心者向けに、農家の確定申告のやり方を全体像から具体的な準備、経費の考え方、必要書類、よくある質問までまとめました。

難しい税金知識を全部覚える必要はありません。まずは売上・経費・お金の流れを毎月整理することから始めてみてください。

農家も確定申告が必要になるケースがある

農業で所得が出る場合は、確定申告が必要になることがあります。農業所得（売上から経費を引いた金額）が一定額を超えると、申告対象になるケースがあります。

会社員で給与が1か所、給与収入が2,000万円以下、年末調整が済んでいる場合は、給与所得・退職所得以外の所得の合計が20万円を超えると、原則として所得税の確定申告が必要になります。

給与が2か所以上ある場合や年末調整が行われていない場合は、20万円以下でも申告が必要になるケースがあるため、判断は税務署や税理士に確認するのが安心です。

所得税の申告が不要な場合でも、住民税の申告が必要になる場合があります。「自分は申告が必要か」「どの範囲が対象になるか」が不安な場合は、税務署に確認するのが一番確実です。

農業を本業にしている方のリアルな収支感は「脱サラ農家の年収の現実｜売上があっても手元に残らない理由」でも整理しています。

農家の確定申告でまず見るのは「農業所得」

農家の確定申告では「農業所得」を計算するところから始まります。計算の考え方はシンプルです。

項目	内容
農業所得の基本	農業による売上（収入）− 農業にかかった経費
青色申告の場合	青色申告決算書（農業所得用）を作成する
白色申告の場合	収支内訳書（農業所得用）を作成する

制度の細かい要件は変更されることがあります。最新情報は国税庁の確定申告書等作成コーナーで確認してください。

農業所得の計算例｜売上から経費を引くとどうなるか

農業所得の計算は、ざっくり「売上から経費を引いた残り」がベースです。あくまでイメージですが、新規就農で小規模に農業を始めた方の年間収支は次のような形になりやすいです。

• 農業売上：直売・いちご狩り・出荷・ネット販売の合計
• 農業経費：苗・肥料・農薬・資材・燃料・修理費・梱包資材など
• 減価償却費：ハウス・農機・冷蔵庫など高額な設備の按分額
• 農業所得：売上 − 経費 − 減価償却費

たとえば年間売上が500万円で、経費が250万円、減価償却費が80万円なら、農業所得は170万円という考え方です（消費税・各種控除は考慮しない簡略な例です。実際の申告では青色申告特別控除や所得控除などにより税額が変わります）。

設備投資が多い年は減価償却費の影響で、売上は出ているのに「手元に残らない感覚」が起きやすくなります。この感覚は、農業を始めて1〜3年目に最も強く出ます。

就農初期の資金繰りは「新規就農の資金はいくら必要？農家が語るリアルな費用と調達法」でもこのギャップを整理しています。

農家の確定申告に必要な書類一覧

農家の確定申告では、申告方法（青色／白色）によって必要書類が変わります。

共通で必要になるもの：

• 確定申告書：所得や税額をまとめる書類
• 本人確認書類：マイナンバーカードまたは通知カード＋免許証など
• 口座情報：還付がある場合の振込口座
• 各種控除の証明書：社会保険料・生命保険料・小規模企業共済など

申告方法ごとの追加書類：

• 青色申告：青色申告決算書（農業所得用・全4ページ）
• 白色申告：収支内訳書（農業所得用）

農家特有で揃えておくとよいもの：

• 売上記録（直売・出荷・いちご狩り・ネット販売の集計）
• 領収書・請求書（苗・肥料・農薬・資材・燃料・修理）
• 農業用通帳・カードの履歴
• 農機具・ハウスなど設備の取得時の領収書
• 補助金の交付決定通知・入金記録
• 固定資産税・農地関連の通知書

書類の様式は毎年微調整されることがあります。その年の様式は必ず国税庁の確定申告書等作成コーナーで確認してください。

初心者が最初にやるべき3つの準備

確定申告で一番大変なのは申告書の記入ではなく、必要な情報を集める作業です。日々の記録を残しておけば、申告作業はかなり楽になります。まず始めてほしい準備を3つに絞りました。

① 売上を記録する

直売・出荷・ネット販売・イベント販売など、現金売上もあれば振り込みもあります。売上があった日に「日付・金額・販売場所」をシンプルにメモしておくだけで、年間集計がずっと楽になります。

専用のノートでも、スマホのメモでも構いません。現金売上ほど漏れやすいので、当日のうちに残すことを優先してください。

② 経費の領収書を残す

苗代・肥料・農薬・資材・燃料・修理費など、農業関連の支出は数えると思ったより多くなります。封筒や箱に月ごとにまとめておくだけでも十分です。

捨てないことが最大のルールです。細かい支出ほど後で思い出せなくなります。

③ 農業用のお金の流れを分ける

農業と家庭のお金が混ざっていると、あとから売上と経費を追うのが大変になります。できれば農業専用の口座やカードを1枚用意しておくのがおすすめです。

丹羽いちご園でも、農業用の口座とカードを会計ソフトと連携してから、整理作業が楽になっただけでなく「こんなものにお金が出ていたのか」と気づいた無駄な支出がいくつかありました。お金の流れを見える化すると、経費の見直しにもつながります。

直売・いちご狩り・出荷・ネット販売の売上管理の違い

農業の売上は販路によって記録のしやすさが大きく違います。販路ごとの特徴を整理しました。

• 直売（現金売上）：日報・売上メモが最重要。レジや日計表があると確実
• いちご狩り：「人数×単価」で集計しやすい。来園者ノートと突き合わせる
• 市場・JA出荷：精算書が後から届く。月ごとに保管しておく
• ネット販売：販売手数料・送料の控除前後の金額に注意。販売プラットフォームの月次レポートを保存
• イベント販売：単発のため記録が抜けやすい。終了直後に売上・経費をその場でメモ

直売・いちご狩り・ネット販売の運営面については「農家が直売を始める方法｜いちご狩りと相性がいい理由と売り方のコツ」や「農家がネット販売を始める方法｜初心者が失敗しやすい発送と手数料の注意点」も参考にしてください。

ネット販売は売上総額と入金額が違うことが多いため、「販売手数料」「送料」「ポイント還元」を経費として整理しておくと申告時に楽です。

農家の経費で迷いやすい支出の具体例

「何が経費になるか」は初心者が一番迷う部分です。農業でよく出てくる支出を整理しました。

• 農業資材（苗・肥料・農薬・マルチ・ビニール・支柱）：比較的わかりやすい経費
• 農機具・設備（農機具・ハウス・灌水設備・冷蔵庫）：高額のものは減価償却になる場合あり
• 燃料・車両（軽トラのガソリン・農機の燃料・車検費用）：農業専用でない場合は家事按分が必要
• 梱包・出荷費（箱・袋・送料・ラベル）：ネット販売の手数料も対象になりやすい
• その他（農業関連の書籍・研修費・通信費の一部）：農業との関連性の説明が必要

初心者がとくに迷いやすい支出を補足します。

• 軽トラのガソリン代：家庭用にも使っている場合は家事按分が必要なケースがある
• 作業服・長靴：農作業専用なら経費にしやすい。プライベート兼用は注意
• 通信費（スマホ・Wi-Fi）：農業利用分のみ家事按分する考え方が一般的
• 自家消費：自分で食べた分は売上計上が必要になることがある
• 接待交際費：取引先との打ち合わせは経費候補。私的な飲食は不可
• 借入の返済：元本は経費にならない。利息部分のみ対象

家事按分や減価償却の判断は、自己判断で進めると後から修正が必要になるケースもあります。迷う支出は税務署や税理士に確認するのが安心です。

農機具・ハウス・冷蔵庫など設備投資と減価償却の考え方

農機具やハウスなど高額な設備は、買った年に全額経費にできないことがあります。これが「減価償却」という考え方です。設備の価値は使うほど少しずつ減っていくため、一定の年数に分けて経費にしていきます。

初心者が押さえておきたいポイント（金額の目安）：

• 10万円未満：基本的にその年の経費にしやすい
• 10万円以上20万円未満：「一括償却資産」として3年で均等償却する方法を選べる場合がある
• 10万円以上30万円未満：青色申告かつ中小事業者などの要件を満たす場合は「少額減価償却資産の特例」で一括経費にできる場合がある（年間合計300万円が上限の目安）
• 30万円以上：耐用年数に応じて毎年少しずつ経費にする（減価償却）
• 中古農機：耐用年数の計算が変わる。中古資産の耐用年数は別途算定

少額減価償却資産の特例と一括償却資産は、適用できる条件・年間上限・申告区分（青色／白色）で扱いが変わります。どちらが有利かは状況によって異なるため、判断に迷う設備投資があった年は税理士への相談が安心です。

農機具やハウスは耐用年数が定められており、農業の現場で使うものは比較的長いスパンの償却になります。

補助金を受けた年に注意すること

補助金は「もらって終わり」ではなく、確定申告でも処理が必要です。補助金の確定申告での扱いは、補助金の性質や使い道によって変わります。

• 収益として計上が必要なケース：補助金を売上や雑収入として申告する
• 圧縮記帳の対象になることも：固定資産の取得に充てた補助金は、要件を満たす場合に圧縮記帳を選べることがあります（適用には決算書での処理など一定の要件があるため、税理士への確認が安心です）
• 受取年度と使う年度が違うケース：処理の方法が分かれる

補助金は金額が大きいため、処理を誤ると申告書の数字が大きくズレます。補助金を受けた年は、税理士への相談をおすすめします。

補助金の申請段階での準備については「新規就農の補助金はどう使う？申請前に準備すべき計画と注意点」も参考にしてください。

消費税・インボイス制度と農家の関係

2023年10月から始まったインボイス制度は、農家にも一部関係します。大まかな考え方を整理します。

• 免税事業者：基準期間（前々年など）の課税売上高が1,000万円以下の事業者は、原則として消費税の納付義務がない
• 課税事業者：課税売上高が1,000万円超になった場合や、インボイス登録した場合は消費税を納める
• インボイス登録の判断：取引先（業務用の卸先・飲食店・直売所など）が課税事業者中心かで影響が変わる
• 農協出荷の特例：農協等を通じた一定の農林水産物の委託販売などでは、生産者がインボイスを発行しなくても買い手側で仕入税額控除を受けられる特例（いわゆる農協特例）が用意されている場合があります。ただし、すべてのJA取引が対象になるわけではなく、無条件特例・委託販売特例など適用条件が分かれます。自分の出荷形態が特例の対象かは、JAや税務署に確認してください

消費者向けの直売・いちご狩り中心の農家と、業務用に出荷する農家ではインボイスの影響が大きく違います。登録の要否は売上規模と販路で判断が分かれるため、税務署や税理士に相談してから決めるのが安心です。

白色申告と青色申告の違い

確定申告には白色申告と青色申告の2種類があります。記帳の手間と控除額が変わります。

• 記帳の手間：白色は比較的少ない／青色は複式簿記が必要（ソフトで対応可）
• 事前申請：白色は不要／青色は「青色申告承認申請書」が必要
• 特別控除：白色はなし／青色は最大65万円（要件あり）
• 赤字の繰越：白色は原則できない／青色は最大3年間繰越できる

青色申告特別控除は、複式簿記・期限内申告・e-Taxまたは電子帳簿保存などの要件で控除額が変わります。詳しい要件は国税庁の青色申告特別控除のページで必ず確認してください。

初年度から青色申告を選ぶ場合、開業届と一緒に青色申告承認申請書を出しておくのがスムーズです。提出期限は開業日から一定期間内です。

兼業農家・副業農業の場合の注意点

会社員をしながら農業をしている兼業農家・副業農家には、専業農家とは違う注意点があります。

• 副業所得20万円ライン：給与が1か所・年末調整済み・給与収入2,000万円以下の場合、給与・退職以外の所得の合計が20万円を超えると所得税の確定申告が必要になることがある（前提が外れる場合は20万円以下でも申告が必要なケースあり）
• 20万円以下でも住民税は別：所得税の申告が不要でも、住民税は申告が必要なケースがある
• 給与所得と農業所得は合算：所得税は両方を合算して計算する
• 会社にバレたくない場合：住民税の納付方法を「自分で納付（普通徴収）」にできる場合がある
• 赤字農業の損益通算：農業が事業所得として認められる場合は、給与所得などと損益通算できる可能性があります。一方、規模・継続性・営利性などから雑所得と判断される場合は、農業の赤字を給与所得と通算できない可能性があるため、税務署や税理士への確認が安心です

副業として農業を始めたばかりの方は、初年度はとくに税務署や税理士に相談したうえで方針を固めるのをおすすめします。

農家目線で一番大事なのは「あとで思い出せる状態」にすること

確定申告の大変さは、申告書の記入よりも「必要な情報が手元にない」ことから来ることがほとんどです。

農業は季節によって支出が大きく偏ります。丹羽いちご園でも、5月の収穫期、8〜9月の育苗・定植準備、12〜2月の収穫繁忙期では、お金の動きがまったく違います。設備投資がある年は特に「売上が出ているのに手元にお金が残らない」感覚になりやすいです。

確定申告直前にまとめようとすると、半年以上前のことを思い出す作業になります。毎月1回、30分だけでも整理する時間を取ると、申告期の負担が大きく変わります。

具体的には、月末や月初に「先月の通帳・カード明細を見て不明な支出がないか確認」「領収書を月の封筒に集める」「現金売上のメモを集計する」の3つを15〜30分で済ませる習慣がおすすめです。完璧でなくて構いません。「あとで思い出せる状態」になっていれば、申告期に時間も気持ちも余裕が生まれます。

会計ソフトを選ぶ前に確認すること

会計ソフトは便利ですが、選ぶ前に確認しておくと失敗しにくいポイントがあります。

会計ソフトは「税金を減らす魔法」ではなく、「記録漏れと、あとで思い出す負担を減らす道具」です。前提として、通帳・カード・領収書がある程度整理されていないと、ソフトを入れても意味が薄くなります。

選ぶ前に確認したい項目：

• 農業用の科目があるか：「種苗費」「肥料費」「農薬費」などが標準で揃っているか
• 通帳・カード連携ができるか：使っている金融機関と連携できるか
• スマホで操作できるか：農繁期に隙間時間で入力できると続きやすい
• 青色申告対応か：将来青色を考えるなら最初から対応ソフトを選ぶ
• 無料体験があるか：入力画面を触ってから判断する
• サポート体制：初心者は電話・チャット相談があると安心

白色申告から始めて、慣れてきたら青色申告に切り替える方も多いです。最初から完璧を目指さず、まずは無料体験で操作画面を確認してみるのが現実的です。

はじめたての時期は、会計ソフト・補助金・節税まわりの営業電話・DMが集中して来やすい時期でもあります。必要なものは使うべきですが、焦って高額プランを契約せず、まず無料体験で合うかを確かめることをおすすめします。

税理士に相談した方がいいケース

下記のような場合は、自分で抱え込まず税理士に相談した方が安心です。

• 設備投資が大きい年：ハウス・大型農機・冷蔵設備など減価償却が複雑になる
• 補助金を受けた年：圧縮記帳など処理が分かれることがある
• 消費税・インボイス制度が絡む：課税事業者の判断や登録の要否
• 家族への給与を考えている：青色事業専従者の要件が関わる
• 赤字でも青色申告で繰越したい：純損失の繰越控除の手続き
• 消費税の還付申告を考えている：判断と手続きが複雑

顧問契約まで考える前に、申告期だけのスポット相談を受け付けている税理士もいます。地域の農協・商工会・新規就農支援センターでも相談窓口が紹介されることがあります。

申告前チェックリスト

申告作業に入る前に、ひととおり確認しておくと安心な項目をまとめました。

このチェックが揃っていれば、申告書の入力作業はかなりスムーズに進みます。

農家の確定申告でよくある質問

Q. 農家の確定申告はいつまでですか？

毎年2月16日〜3月15日が基本です（土日の関係で前後する年があります）。期限を過ぎると延滞税や無申告加算税の対象になる可能性があるため、早めの準備をおすすめします。

Q. 農家の経費はどこまで認められますか？

農業に直接使う支出は経費の候補になりやすいです。ただし家庭兼用のもの（車・通信費など）は家事按分が必要なケースがあります。判断に迷うものは税務署や税理士に確認するのが確実です。

Q. 兼業農家でも確定申告は必要ですか？

給与が1か所・年末調整済み・給与収入2,000万円以下の場合は、給与・退職以外の所得の合計が年間20万円を超えると所得税の確定申告が必要になることがあります。前提が外れる場合は20万円以下でも申告が必要なケースがあります。

また所得税の申告が不要でも、住民税は申告が必要な場合があるため、市区町村の窓口に確認するのが安心です。なお、医療費控除や住宅ローン控除（初年度）など還付を受けたい場合は、20万円ラインに関わらず確定申告が必要になります。

Q. 農業が赤字でも確定申告した方がいいですか？

農業が事業所得として認められる青色申告であれば、純損失を最大3年間繰越できる場合があります（純損失の繰越控除）。一方、規模が小さく雑所得と判断される場合は、給与所得との損益通算や繰越ができないことがあります。設備投資が大きい初年度・新規就農の方は、申告の要否と区分について税務署や税理士に相談しておくと安心です。

Q. 会計ソフトだけで申告できますか？

会計ソフトの多くは申告書の出力に対応していますが、入力する売上・経費が整理されていることが前提です。領収書や売上記録が散らかったままだと、ソフトを入れても作業負担はあまり減りません。

Q. 税理士に相談した方がいいのはどんな場合ですか？

大型の設備投資・補助金の処理・消費税やインボイス・家族への給与・赤字繰越などが絡む場合は、税理士への相談を検討してください。スポット相談を受け付けている税理士もいます。

初心者が確定申告で焦らないための注意点

はじめたての時期は、節税・補助金・会計ソフトの営業が集中しやすい時期です。

• 「絶対に得する」「今だけ」と言われたら一度立ち止まる：契約は焦らない
• 知らない用語が出てきたら必ず確認する：圧縮記帳・繰延・特別償却など
• 無料セミナー＝勧誘の場のこともある：内容と勧誘の区別を意識する
• 判断に迷ったら税務署・税理士に確認する：自己判断で進めない

新規就農で失敗しやすいお金の落とし穴は「新規就農で失敗する原因は出口戦略にある｜販路とお金の準備リスト」でも整理しています。

まとめ｜農家の確定申告は「日々の記録」が一番大事

この記事では、農家の確定申告のやり方を全体像から具体的な準備、必要書類、よくある質問まで整理しました。

• 売上を日付ごとに記録する：現金売上ほど漏れやすい
• 経費の領収書を1か所に残す：細かい支出ほど後で思い出せない
• 農業用のお金の流れを分ける：通帳・カードを分けるだけで楽になる
• 必要書類は早めに確認する：その年の様式は国税庁で確認
• 白色か青色かは要件と手間で判断：青色は要件で控除額が変わる
• 設備投資・補助金がある年は税理士相談：自己判断で進めない
• 会計ソフトは「思い出す負担」を減らす道具：焦って高額契約しない
• 迷う部分は税務署・税理士に確認：これが一番の保険

農家の確定申告は、申告期に頑張ることではなく、毎月の小さな整理の積み重ねで決まります。今からでも遅くないので、まずは領収書を1か所にまとめるところから始めてみてください。

この記事はAI（Claude）の支援で作成し、農家本人（丹羽）が内容を確認・監修しています。最終的な税務判断は、税務署または税理士にご確認ください。